Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms