Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LINC01021-203ENST00000510165 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.79-201ENST00000610676 290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms