Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JAG1P78504 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JAG1P78504 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JAG1P78504 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
JAG1P78504 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JAG1P78504 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JAG1P78504 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JAG1P78504 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JAG1P78504 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JAG1P78504 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JAG1P78504 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms