Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPNP63162 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPNP63162 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPNP63162 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPNP63162 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPNP63162 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPNP63162 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPNP63162 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPNP63162 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms