Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms