Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms