Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA2P51531 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA2P51531 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCA2P51531 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCA2P51531 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms