Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CRATP43155 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRATP43155 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRATP43155 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms