Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms