Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms