Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms