Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJC1P36383 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJC1P36383 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms