Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms