Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms