Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms