Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms