Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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