Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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