Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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