Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms