Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME1P15531 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms