Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RLBP1P12271 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms