Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms