Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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