Protein–RNA interactions for Protein: O94823

ATP10B, Probable phospholipid-transporting ATPase VB, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10BO94823 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP10BO94823 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP10BO94823 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms