Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB3O43889 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms