Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms