Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F3O00716 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms