Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
O00370 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
O00370 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
O00370 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
O00370 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
O00370 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
O00370 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
O00370 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
O00370 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
O00370 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
O00370 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
O00370 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
O00370 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
O00370 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
O00370 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms