Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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