Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms