Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms