Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB5A4FU69 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB5A4FU69 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB5A4FU69 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB5A4FU69 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB5A4FU69 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB5A4FU69 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB5A4FU69 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB5A4FU69 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms