Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144AA2RUR9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms