Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms