Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms