Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms