Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms