Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRPF3Q9ULD4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms