Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA3Q9UL41 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms