Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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