Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms