Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms