Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms