Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms