Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms