Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms