Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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