Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNIH4Q9P003 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms