Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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